Специализираната администрация подпомага и осигурява осъществяването на правомощията на министъра като орган на изпълнителната власт, свързани с неговата компетентност.
Специализираната администрация е организирана в 16 дирекции:
Специализирана администрация
- Политики за стратегическо развитие, квалификация и кариерно развитие
- Приобщаващо образование
- Учебници и училищна документация
- Съдържание на предучилищното и училищното образование
- Професионално образование и обучение
- Организация и контрол
- Образование на българите зад граница и училищна мрежа
- Висше образование
- Наука
- Международно сътрудничество
- Външни европейски програми
- Държавна собственост и обществени поръчки
- Финанси
- Правна
- Информационни и комуникационни технологии
- Управление и изпълнение на проекти